Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg6P61406 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smg6P61406 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg6P61406 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms