Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snap25P60879 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms