Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms