Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms