Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bace1P56818 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms