Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms