Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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