Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NcanP55066 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NcanP55066 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NcanP55066 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NcanP55066 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NcanP55066 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NcanP55066 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NcanP55066 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NcanP55066 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NcanP55066 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NcanP55066 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NcanP55066 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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