Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FmodP50608 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FmodP50608 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FmodP50608 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms