Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms