Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms