Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc3P33622 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms