Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Saa4P31532 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Saa4P31532 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Saa4P31532 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Saa4P31532 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Saa4P31532 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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