Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms