Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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