Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms