Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aco1P28271 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms