Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgaP26339 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgaP26339 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgaP26339 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms