Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo2P25801 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms