Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gja1P23242 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gja1P23242 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gja1P23242 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms