Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms