Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Fcer1aP20489 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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Fcer1aP20489 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Fcer1aP20489 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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