Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
VimP20152 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VimP20152 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
VimP20152 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VimP20152 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VimP20152 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VimP20152 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
VimP20152 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VimP20152 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VimP20152 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VimP20152 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VimP20152 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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