Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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