Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18532 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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P18532 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18532 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18532 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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