Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18525 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18525 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18525 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18525 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
P18525 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18525 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18525 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18525 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18525 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18525 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18525 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18525 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18525 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18525 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18525 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18525 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18525 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms