Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms