Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms