Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

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Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms