Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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