Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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