Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Stra6O70491 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Stra6O70491 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Stra6O70491 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Stra6O70491 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stra6O70491 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Stra6O70491 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Stra6O70491 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stra6O70491 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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