Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdmt1O55055 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms