Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn5O54942 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn5O54942 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn5O54942 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn5O54942 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn5O54942 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn5O54942 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn5O54942 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Cldn5O54942 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Cldn5O54942 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Cldn5O54942 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Cldn5O54942 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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