Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TsksO54887 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TsksO54887 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TsksO54887 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TsksO54887 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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TsksO54887 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TsksO54887 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TsksO54887 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TsksO54887 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TsksO54887 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TsksO54887 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms