Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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