Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DffaO54786 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DffaO54786 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms