Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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