Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Sp100O35892 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
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Sp100O35892 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sp100O35892 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sp100O35892 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sp100O35892 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Sp100O35892 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Sp100O35892 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Sp100O35892 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Sp100O35892 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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