Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Olfr434-201ENSMUST00000076752 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 AC133934.1-201ENSMUST00000223052 1761 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm45625-201ENSMUST00000209412 650 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms