Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx1aO35526 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms