Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Prrt1O35449 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Prrt1O35449 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Prrt1O35449 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Prrt1O35449 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Prrt1O35449 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Prrt1O35449 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Prrt1O35449 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Prrt1O35449 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Prrt1O35449 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Prrt1O35449 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Prrt1O35449 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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