Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms