Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1aO35134 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1aO35134 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1aO35134 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1aO35134 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1aO35134 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1aO35134 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1aO35134 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1aO35134 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Polr1aO35134 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Polr1aO35134 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Polr1aO35134 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Polr1aO35134 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Polr1aO35134 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1aO35134 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms