Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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LhbO09108 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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LhbO09108 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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LhbO09108 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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LhbO09108 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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LhbO09108 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LhbO09108 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
LhbO09108 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LhbO09108 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
LhbO09108 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
LhbO09108 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LhbO09108 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LhbO09108 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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