Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Degs1O09005 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Degs1O09005 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Degs1O09005 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Degs1O09005 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms