Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms