Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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