Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx2O08686 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms