Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC117090L7N257 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms